故事发生正在东京八丈岛远海，这里建成为了一座联接了全世界各地警方监控摄像的陆地举措措施“承平洋浮标”。正在这座举措措施正式启动以前，为了与欧洲刑警组织统领的范畴联网，世界列国的IT工程师离开现场。而与此同时，一项使用了人脸辨认体系的“新手艺”的测试也正在举行中……　　另外一方面，柯南以及少年侦探团正在园子的接待上去到八丈岛赏鲸。此时，柯南接到来自冲矢昂（赤井秀一）的德律风，原告知欧洲刑警组织的成员正在德国受到琴酒的戕害。为查询拜访实情，柯南偷偷混进了前去“承平洋浮标”举行戒备事情的黑田兵卫等警视厅职员乘坐的戒备艇中，进入举措措施外部。之后，正在为体系启动而稳步开展筹备事情的举措措施内，发生结案件——一位女性工程受到黑衣组织的绑架，而她手中装有某些谍报的U盘也落到了黑衣组织的手里。　　海中传来使人不寒而栗的螺旋桨声。而此时身正在八丈岛的灰原哀身旁，也正有黑影正在暗暗挨近……
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